工商注册代理公司的年检服务费用因地区和具体情况而异，但一般来说，目前已经没有工商年审制度，而是统一改为公司年报制度。年报制度不需要他人进行代办，也不收费，即公司直接通过网络进行申报，无需支付年检费用。
然而，如果公司选择找代理代办公司进行年报的办理，这些代理公司可能会收取一定的代办费用。根据参考文章中的信息，这些代办费用大致在500-1000元之间，但具体费用可能因地区、服务内容、公司规模等因素而有所不同。因此，建议公司在选择代理代办公司时，先咨询多家公司并比较其服务内容和价格，选择最适合自己的服务。
总结来说，工商注册代理公司的年检服务费用因公司是否选择代办而有所不同。如果公司选择自行进行年报申报，则无需支付年检费用；如果公司选择找代理代办公司进行年报的办理，则需要支付一定的代办费用，具体费用需根据代理公司的收费标准而定。